Bien que certaines espèces d'oiseaux arrivent à tirer profit des opportunités présentes en milieu urbain, les villes et autres milieux habités regorgent de menaces pour la faune ailée : collisions avec les fenêtres ou les voitures, chats en liberté, pollution lumineuse, espèces non indigènes et compétitrices comme le Moineau domestique ou l’Étourneau sansonnet…
QuébecOiseaux travaille à rendre les milieux urbains plus accueillants pour les oiseaux grâce, entre autres, à ses initiatives de conservation du Martinet ramoneur et à l’installation et au suivi de nichoirs pour différentes espèces, dont l’Hirondelle noire. De plus, QuébecOiseaux est le partenaire provincial de la certification pancanadienne Ville amie des oiseaux, qui vise à rendre les villes et municipalités plus sécuritaires pour les oiseaux en réduisant les menaces en milieu urbain et en favorisant la conservation et la restauration des habitats.